Mol Cell:张锋再造先导组合抗病毒的新型CRISPR Cas13系统

全因，麻省理工学院和纽约大学Broad研究课题所传来他将会：Pardis C. Sabeti、张锋等地质学家联合开发新出一种新型的抗病毒原体的系统。21世纪上有许多常见的可怕寄生虫都是基于脱氧核糖核酸RNA的寄生虫，像是乙型肝炎寄生虫、屯兵卡寄生虫和流感寄生虫。该的系统在CRISPR Cas13核心技术的基础上再次系统升级，可用以监测和损害全人类细胞核里带有脱氧核糖核酸RNA的寄生虫。该研究课题刊载在《Molecular Cell》月刊上。CRISPR的系统为抗病毒原体方法有带来曙光此前，张锋设计团队的研究课题工作人员凭借着CRISPR/Cas9的系统为加固免疫的系统抵挡寄生虫入侵带来重新努力。然而，入侵全人类的寄生虫极为多变，即使是在同一若无种内，也能不断后天。因此我们需要相当轻松的预防性寄生虫和平台。为了探索重新抗病毒原体策略，研究课题工作人员将目光投向了CRISPR Cas13的系统，Cas13酶可以天然地核酸细菌里的寄生虫RNA。它可以对核糖体顺利完成编程，从寄生虫颗粒里去除特定的核糖核酸序列。尽管CRISPR Cas13的系统仍然存在一些局限特质，但是该方法有在麻省理工学院室里较易转换，并且此前张锋设计团队的研究课题工作人员在哺乳动若无细胞核里早就顺利完成了适当的麻省理工学院证明了。研究课题工作人员开发新了一种名为CARVER的新型和平台，它能将Cas13内源性的寄生虫RNA裂解与基于Cas13的短时间内病症读数相结合起来，常用特定的高灵敏度酶报告小分子可选择（SHERLOCK）和平台，监测打倒基于RNA的寄生虫。创建两大的的系统研究课题工作人员首先筛选了350多个全人类相关寄生虫（HAV）DNA，以鉴定Cas13可以直接核酸的寄生虫RNA序列。他们主要四处寻找的是既较难凋亡，又最有有可能在切割后禁用寄生虫的相片。寄生虫DNA里潜在的Cas13远距离核糖体纽约大学Cameron Sabeti麻省理工学院室的普林斯顿大学Myhrvold博士暗示：“前提，你可以编程Cas13来反击寄生虫的任何部分。但是若无种内外和若无种之间都有非常大的多样特质，随着寄生虫的进化，仅有DNA都频发了快速的变化。如果你不小心，你有可能会自觉再一没直接果的远距离。”然后，他们通过计算分析化学合成统计数据，以已确定数百种寄生虫若无种里的数千个潜在核糖体，这些核糖体有可能是Cas13的直接靶标。接下来，研究课题工作人员设计了该的系统的Cas13教导RNA。新编程的Cas13在感染了淋巴细胞核特质脉络膜高血压寄生虫（LCMV）、甲型流感寄生虫（IAV）和小便特质口炎寄生虫（VSV）的全人类细胞核里顺利完成了麻省理工学院测试。将Cas13引入仪器后24小时，研究课题工作人员掩蔽到培养若无里寄生虫RNA的水平减少了40倍。随后，研究课题工作人员检查了Cas1抑制寄生虫感染特质的并能。研究课题统计数据标示出：寄生虫暴露后八小时，Cas13将流感寄生虫的感染力减少了300倍以上。最后，该设计团队常用SHERLOCK监测核心技术来实时测量Cas13核酸后的寄生虫RNA水平。该监测的系统提供了有关治果的短时间内反馈以及有关特定寄生虫凋亡的讯息。结语对于寄生虫感染的用药，虽然早就批文了90多种抗病毒若无，但它们只能用药9种疾病。总体而言，只有16种寄生虫带有FDA批文的疫苗。因此，找到行之直接的抗病毒原体方法有显得尤为重要。该研究课题的第一作者 Catherine Freije 暗示：“Cas13可以是一种研究课题方法有，来探索全人类细胞核里寄生虫生若无学的许多不足之处，它也有可能是一种病理方法有，用以病症样本，用药寄生虫感染，并量化用药的直接特质——所有这些都能让CARVER在重新或耐药特质寄生虫出现时快速充分利用和应对。”原始出处:PFreije CA1, Myhrvold C2, Boehm CK3, et a1.Programmable Inhibition and Detection of RNA Viruses Using Cas13.Mol Cell. 2019 Oct 2. pii: S1097-2765(19)30698-7. doi: 10.1016/j.molcel.2019.09.013. [Epub ahead of print]